9月9日
北朝鮮が核実験
9月9日
桐生祥秀 陸上100ｍで９秒98 日本選手初の９秒台
9月11日
体外受精件数が過去最多42万件
9月8日
2017年（平成29年）9月15日に公布された公認心理師法に基づき、第1回公認心理師国家資格試験が実施された。
9月8日
テニス女子 大坂なおみ 全米オープン優勝
9月9日
岐阜県内の養豚場で3日から8日にかけて死んだ豚から豚熱ウイルス（当時の呼称は「豚コレラウイルス」）が検出され、これまでに80頭が死亡したことを県が発表。9日から10日にかけて残る610頭について殺処分が施された。またこれを受け農林水産省は豚肉の日本国外への輸出を停止した。豚熱（当時の呼称は「豚コレラ」）の発生は1992年の熊本県以来26年ぶりとなる。
9月13日
ジャニーズ事務所所属のアイドルユニット「タッキー&翼」が9月10日付を以て解散していたことを発表。滝沢秀明は年内で芸能活動から引退し舞台などのプロデュースに専念することと今井翼が持病であるメニエール病の治療に専念するために近くジャニーズ事務所を退社することも併せて発表。
9月13日
東日本大震災で行方不明となった宮城県石巻市の男性1人が滋賀県内で見つかったため、東日本大震災による行方不明者数は2536人となった。
9月8日
台風15号により千葉県などで大きな被害。「令和元年房総半島台風」と命名される。
9月9日
未明、令和元年房総半島台風（台風15号）が関東地方東部に上陸、千葉県を中心に暴風や停電による甚大な被害をもたらした。関東では観測史上最強の台風と呼ばれた。千葉県市原市ではこの台風により市原ゴルフガーデン鉄柱倒壊事故が発生した。
9月11日
安倍晋三首相（自民党総裁）は内閣改造・党役員人事に着手。同日に、第4次安倍第2次改造内閣ならびに新しい自民党執行部が発足。
9月8日
前原誠司元外務大臣が2010年に尖閣諸島沖で発生した海上保安庁の巡視船と中国漁船が衝突した事件について、当時の菅直人首相が逮捕した中国人船長の釈放を求めたことを明らかにしたと、産経新聞が報じた。
9月9日
東京地検特捜部は、カジノを含む統合型リゾート事業をめぐる汚職に絡む証人買収事件で贈賄側の別の関係者にも嘘の証言をさせようとしたとして、衆議院議員の秋元司を組織犯罪処罰法違反の疑いで再逮捕した。
9月10日
NTTドコモの提供する送金・決済サービスの「ドコモ口座」で1800万円を超える不正引き出しが発覚した問題で、NTTドコモは会見を開き、丸山誠治副社長らが謝罪した。
9月10日
旧立憲民主党、旧国民民主党などによる合流新党の代表選が行われ、立憲民主党の枝野幸男代表が国民民主党の泉健太政調会長を破り初代代表に選ばれた。新党の党名は「立憲民主党」に決まった。
9月10日
高知市内にある電柱の開閉器を故意に操作し、付近の1000世帯余りを停電させたとして、高知県警高知南署は四国電力のグループ会社である四電工の26歳の社員の男を電気事業法違反及び威力業務妨害容疑で逮捕。現場周辺では他にも同様の被害が数件発生していた。
9月10日
自民党総裁選に立候補した菅義偉官房長官が、出演したテレビ東京の番組で将来的に消費税を再度引き上げる必要があるとの考えを示した。
9月10日
東京都は、新型コロナウイルスの感染拡大を受けて23区内の飲食店などに出している午後10時までの営業時間短縮要請について、予定通り9月15日で終了することを決めた。
9月11日
WEST EXPRESS 銀河が京都駅 - 出雲市駅間で運行を開始。当初は5月8日の運行開始予定だったが、コロナの影響により4か月遅れでの運行となった。
9月12日
第77回ヴェネツィア国際映画祭で、『スパイの妻』の監督を務めた黒沢清が銀獅子賞（監督賞）を受賞。1952年の溝口健二、2003年の北野武に次ぐ日本人3人目の受賞者となった。
9月14日
自由民主党総裁選挙は午後に東京都内のホテルで開かれた両院議員総会で投開票を行い、菅義偉官房長官が岸田文雄政調会長、石破茂元幹事長を破って圧勝し、第26代総裁に選出された。
